Syntetický astaxanthin apřírodní astaxanthinjsou podstatně odlišné; jejich antioxidační kapacita, obsah a čistota nejsou stejné. Liší se strukturou. Proto existují rozdíly v jeho účinnosti a roli.
Vyrábí se dvěma způsoby: umělou syntézou a biologickou akvizicí. Umělá syntéza je chemická metoda získaná z karotenu; biologicky přirozené má obecně tři biologické zdroje: odpad z průmyslu zpracování vodních produktů, Phaffia rhodozyma a mikrořasy (hlavně Haematococcus Pluvialis).
Vyrábí se dvěma způsoby: umělou syntézou a biologickou akvizicí. Syntetika je nejen drahá, ale také se výrazně liší od přírody, pokud jde o strukturu, funkci, použití a bezpečnost.
Z hlediska struktury:
Kvůli optické aktivitě hydroxylových skupin (-oh) na obou koncích má tři izomery: 3s-3's, 3r-3's, 3r-3's (také známý jako levotočivý, racemický, pravotočivý) typ, ve kterém syntetický je směsí 3 druhů struktury (25 procent levotočivé, 25 procent pravotočivé a asi 50 procent racemické), s malou antioxidační aktivitou, odvozené z kvasnic It je 100% pravotočivý (3r-3'r) a má částečnou antioxidační aktivitu; jejichž dva výše uvedené zdroje se používají hlavně při barvení nepoživatelných zvířat a materiálů. Pochází pouze z řas, které mají 100% levotočivou (3s{21}}) strukturu a mají nejsilnější biologickou aktivitu.
Chemická syntéza nevyhnutelně zavede chemikálie nečistot, jako jsou nepřirozené vedlejší produkty generované během procesu syntézy, což sníží bezpečnost biologické dostupnosti. S rozmachem přírody je hospodaření s chemicky syntetizovanými produkty v zemích po celém světě stále přísnější. Například americký Úřad pro potraviny a léčiva (FDA) zakázal vstup chemicky syntetizovaných na trh potravin a doplňků stravy (Suplements) a společnost Natural získala certifikaci obecné bezpečnosti (GRAS) u FDA. Může legálně vstoupit na trh potravin a doplňků stravy. Jeho produkce obecně směřuje k rozvoji biologických zdrojů přírody a tím k produkci ve velkém měřítku.
Různé zdroje astaxanthinu mají jiné chemické struktury a různé antioxidační kapacity. A silná antioxidační kapacita astaxanthinu se odráží v jeho jedinečném designu. Astaxanthin extrahovaný z Haematococcus Pluvialis má 100% levotočivou strukturu se super silnou antioxidační kapacitou a jeho biologická účinnost je také super silná. Astaxanthin pocházející z Phaffie má 100% pravotočivou strukturu. Jeho antioxidační kapacita je druhá; získává se z ryb, krevet, krabů a dalších zvířat a je směsí tří forem. Antioxidační síla je druhá a poslední je umělá syntéza. Astaxanthin je 100% racemická struktura, bez jakékoli antioxidační kapacity a nemá žádnou biologickou účinnost, kterou by astaxanthin měl mít, takže jej lze použít pouze jako chemické barvivo.
Proto,přírodní astaxanthinje lepší než syntetický astaxanthin ve struktuře, fyziologické funkci, aplikačním účinku a bezpečnosti.
