Astaxanthin je červený pigment, který existuje v mnoha přírodních organismech.Přírodní astaxanthinse vyskytuje hlavně u mořských organismů, které se liší od chlorofylu a β-karotenu v suchozemských rostlinách. Jedná se o formu mikrořas, která je konzumována mnoha různými typy vodních organismů. Silná červená pigmentace Astaxanthinu způsobuje, že tato zvířata mají červené nebo růžové maso nebo skořápky.
Červený losos nalezený ve volné přírodě Tichého oceánu je jednou z nejvyšších koncentracípřírodní astaxanthin, s výjimkou H. Pluvialis. Tento pigment dává rybímu masu ikonické tmavě červené a neuvěřitelně zdravé antioxidační vlastnosti. Mezi další přírodní zdroje astaxanthinu patří humr, arktické krevety, krab, rak, pstruh obecný, řasy a krill. Červení ptáci obvykle získávají svou barvu tím, že jedí ryby a rostliny bohaté naastaxanthin, ale jejich koncentrace pigmentu jsou obvykle nízké.
Ačkoli mořský život je nejčastějším zdrojempřírodní astaxanthin, není omezena na rostliny a živočichy na vodní bázi. Například kvasinky zvané Xanthophyllomyces dendrorhous (kvasinky Phaffia) také obsahují relativně vysoké hladiny astaxanthinu. Je výrobcem astaxanthinu. Nebude ji absorbovat z jiných organických zdrojů.
